Di Amerika Barat Lama, balapan terbesar di dunia akan segera dimulai. Ribuan orang berbaris di San Diego untuk menempuh jarak lebih dari enam ribu kilometer demi kesempatan memenangkan hadiah utama sebesar lima puluh juta dolar. Dengan berakhirnya era kuda, para peserta diperbolehkan menggunakan kendaraan apa pun yang mereka inginkan. Para pesaing harus menanggung kondisi yang melelahkan, menempuh jarak hingga seratus kilometer sehari melalui gurun yang belum dipetakan. Steel Ball Run benar-benar merupakan acara yang unik.
Johnny Joestar muda, seorang mantan penunggang kuda yang cacat, datang ke San Diego untuk menyaksikan dimulainya balapan. Di sana ia bertemu Gyro Zeppeli, seorang penunggang kuda dengan dua bola baja di pinggangnya sebagai pengganti pistol. Johnny menyaksikan Gyro menggunakan salah satu bola bajanya untuk melepaskan kekuatan fantastis, memaksa seorang pria untuk menembak dirinya sendiri selama duel. Di tengah aksi tersebut, Johnny secara tidak sengaja menyentuh bola baja dan merasakan kekuatan mengalir melalui kakinya, memungkinkannya untuk berdiri untuk pertama kalinya dalam dua tahun. Bertekad untuk menemukan rahasia bola-bola baja, Johnny memutuskan untuk ikut serta dalam perlombaan, dan begitulah petualangan anehnya melintasi Amerika dalam Steel Ball Run dimulai.
